项目名称 血叶兰基因组及兰科30个物种进化分析 项目编号 EJWJ2025100 公告开始日期 2025-06-11 18:23:08 公告截止日期 2025-06-16 19:00:00 采购单位 福建农林大学 付款方式 货到验收付款 联系人 登录后可见 联系电话 登录后可见 签约时间要求 成交后5日内 到货时间要求 预算总价 ￥

30000.00

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血叶兰基因组及兰科30个物种进化分析 1 项 技术测试和分析服务 无 无 品牌 品牌1 型号 品牌2 型号 品牌3 型号 品牌4 型号 品牌5 型号 品牌6 型号 预算单价 ￥ 30000.00 技术参数及配置要求 血叶兰基因组及兰科30个物种进化分析：1、基因家族鉴定：基因家族的鉴定，是进化分析很重要的一个方面。通过同源基因的鉴定及基因家族的聚类分析，可以得到单拷贝基因家族和多拷贝基因家族。单拷贝直系同源基因家族在物种之间都是比较保守的。还可以得到物种特有的基因和家族，它们可能和物种的特异性有关。2、系统发育分析：用单拷贝基因家族构建物种发育树。不同物种的变异速率和该物种的个体大小或者世代周期有关，较大的个体、较长的世代周期一般有较慢的变异速率。在构建系统法发育树的时候，我们把所有的单拷贝基因家族分别进行多序列比对，然后把所有的比对结果按照物种顺序串联在一起，用于构建系统发育树，称之为super alignment matrix。3、分化时间估算：分子钟理论：在各种不同的发育谱系及足够大的进化时间尺度中，许多序列的进化速率几乎是恒定不变的。因此，根据这一理论，我们可以用物种上比较保守的单拷贝基因来 计算物种的分歧时间。分歧时间指多个物种从祖先节点分开开始所经历的时间段，是一种宏观尺度。4、基因家族收缩扩张：在物种进化的过程中，某些基因可能会复制多份拷贝，同时本身有些不太保守的基因可能会丢失。这些复制或者丢失的基因往往会让物种出现当前的形态以适应其所处的生境。5、共线性分析：在共线性片段内部，基因在功能上以及排列顺序上都是保守的，这些基因在物种进化过程中保持了高度的保守性。6、全基因组复制分析：通过计算全基因组所 有同源基因对的Ks值，可以推测出基因复制或者分化发生的大概时间；通过全基因组范围内同源基因对的Ks值分布峰值，可以判断出各物种是否有发生过WGD。 参考链接 售后服务 2025-06-11 18:23:08